Death Note berkisah tentang seorang pemuda jenius bernama Yagami Raito [Tetsuya Fujiwara] yang menemukan sebuah buku kematian/death note yang –menurut Raito- secara tidak sengaja jatuh ke dunia manusia. Raito yang semula menganggap petunjuk yang tertulis di buku itu hanyalah sebuah lelucon akhirnya percaya dengan kekuatan membunuh Death Note bahwa nama orang yang ditulis di Death Note itu akan mati, ketika ia pertama kali melakukannya. Di saat itu pula ia bertemu dengan Shinigami (dewa kematian) pemilik asli Death Note bernama Ryuk. Ryuk selalu berada di dekat Raito dan ia sangat menyukai apel.
Kehidupan Raito yang awalnya biasa saja dengan segala hal yang menurutnya membosankan dan penuh dengan ketidakadilan berubah. Dengan memakai nama “KIRA” dan berbekal data yang ia dapatkan dari link/jaringan internet kepolisian yang sebenarnya sangat rahasia, Raito kemudian memutuskan untuk menciptakan Utopia/Negeri Impian dengan cara menghabisi para kriminal di dunia( di dunia belahan manapun itu) menggunakan Death Note tersebut. Ia menganggap dirinya sebagai tuhan bagi dunia yang baru. Ada masyarakat yang pro dengan aksi “KIRA”, tetapi tidak sedikit pula orang yang mengecam aksi semena-mena “KIRA”, termasuk Kepala kepolisian Yagami Shoichiro, ayah Raito sendiri. Kematian ‘mendadak’ para kriminal yang menimbulkan tanda tanya bagi warga dunia membuat Raito harus berhadapan dengan seorang detektif terbaik di dunia, bernama "L”, detektif jenius dan agak aneh yang disewa untuk menemukan sang pelaku pembunuhan para kriminal belakangan itu.